Het stadsbestuur van Maaseik is samengesteld uit 27 raadsleden, die op 8 oktober 2006 werden verkozen. De gemeenteraad legt de grote beleidslijnen vast. De raad vergadert minstens 10 keer per jaar, normaal op de vierde maandag van de maand. De uitnodiging van de gemeenteraad, waarop iedereen welkom is, wordt zeven vrije dagen vooraf opgehangen in het administratief cenrtum Maaseik, het administratief centrum Neeroeteren en in de bibliotheken.

Het college van burgemeester en schepenen is belast met het dagelijks bestuur, de voorbereiding en uitvoering van het gemeenteraadsbeslissingen. Het college vergadert wekelijks in gesloten zitting over de meest verschillende problemen, onderwerpen en vragen. Het college bestaat uit de burgemeester-voorzitter, zeven schepenen, waaronder de OCMW-voorzitter en de stadssecretaris die de notulen opstelt en zorgt voor de uitvoering van de beslissingen voor administratie en diensten.